Ateliers et réunions satellites

Pour toute information, merci d'envoyer un mail à smap2019-workshops@sciencesconf.org

 

Réunion des responsables de plateformes protéomiques : Feuille de route pour la protéomique en France

Personnes animant l’atelier : Myriam Ferro

Contexte : Réunion annuelle des PF Protéomiques organisée par ProFI (Proteomics French Infrastructure)

Date et lieu : Lundi 16 septembre 2019 à 14h; accueil des participants à partir de 13h30 (Amphithéatre Grünewald, IPHC, Batiment 25, voir plan).

Contact pour l'inscription : Myriam Ferro

 

Club Jeunes : Réunion annuelle des deux clubs jeunes

Personnes animant l’atelier : Responsables des différents CJ : CJSFEAP et CJSM

Public envisagé : La demi-journée est libre d’accès pour tout adhérent à l'un des clubs

Contexte : Cette demi-journée est l’occasion pour nos membres de présenter leurs résultats et d’échanger entre jeunes chercheurs.

Un appel à communication vous sera adressé par vos CJ respectifs. Chaque CJ sélectionnera trois présentations orales de 15 minutes (suivies de questions). Sur l’ensemble des 6 présentations, la plus appréciée par les participants à la demi-journée sera sélectionnée pour un créneau durant le congrès SMAP 2019.

Pour avoir plus d’information au sujet de cette demi-journée, nous vous encourageons à contacter le Club Jeune auquel vous appartenez.

Date et lieu : Lundi 16 septembre matin (amphithéatre Grünewald, IPHC, Batiment 25, voir plan).

Contact pour l'inscription: CJSFEAP et CJSM

http://cjsfeap.free.fr/  http://www.cjsm.sfsm.fr/

 

Workshop 1 : FT-ICR et spectrométrie de masse haute résolution [COMPLET]

Personnes encadrant la formation : Marc-André DELSUC

Public envisagé et prérequis : L'atelier est ouvert aux personnes intéressées par la spectrométrie de masse FT-ICR, ou à ceux qui souhaitent participer au TGE ou au réseau européen EU FT-ICR MS.

Objectif de la formation :

Compétences acquises à la sortie de la formation :

Durée : 3 heures.

Date et lieu : Lundi 16 septembre 2019 à 14h (Salle à confirmer).

Contact pour l'inscription : Marc-André DELSUC

Inscription gratuite mais obligatoire, atelier limité à 40 participants.

 

Workshop 2 : Spectrométrie de masse et analyse bio-structurale : SM native, échange H/D et couplage par pontage chimique (XLMS) [COMPLET]

Personnes encadrant la formation  : Oscar HERNANDEZ-ALBA (LSMBO, Strasbourg) et Noelle POTIER (LSMIS, Strasbourg)

Public envisagé et prérequis : Cette formation est ouverte à toute personne intéressée par les possibilités de la spectrométrie de masse (SM) dans un cadre d’analyse en biologie structurale. Aucune expertise dans le domaine n’est requise.

Objectif de la formation : Découvrir le potentiel et les limitations de la SM pour l’étude des complexes biologiques non covalents. Quelles informations structurales peut-on extraire des données de SM ?

Les bases des deux méthodologies seront présentées. Les obstacles expérimentaux (préparation de l’échantillon et choix des paramètres instrumentaux en SM native ; mise au point d'une expérience HDX ; choix du protocole de cross-linking, interprétation des données en XLMS) seront discutés. Des exemples illustreront le potentiel de ces approches :

  • détermination de la stoechiométrie d’interaction (complexe protéine/protéine, protéine/ligand, protéine/ARN)
  • étude de la dynamique d’association
  • apport de la mobilité ionique (IM)
  • comment aborder l’étude des domaines d’interaction
  • comment la SM entre dans une approche intégrative de méthodes d’analyse structurale.

Durée : 3 heures.

Date et lieu : Lundi 16 septembre 2019 à 14h (Salle à confirmer).

Contacts pour l'inscription  : Oscar HERNANDEZ-ALBA et Noelle POTIER

Inscription gratuite mais obligatoire, atelier limité à 40 participants.

 

Workshop 3 : Multi–omics data integration [COMPLET]

Personnes encadrant la formation : Delphine PFLIEGER et Christophe BATTAIL

Public envisagé et prérequis : ingénieur, étudiant ou chercheur travaillant avec un type d’analyse omique (protéomique, génomique, métabolomique), biologistes, bioinformaticiens.

Objectif de la formation : Savoir formuler précisément des questions requérant l’intégration de plusieurs données omiques ; avoir une vue d’ensemble de la mise en œuvre des analyses omiques dans les contextes de recherche décrits ; introduction à des stratégies bioinformatiques permettant de répondre aux questions posées.

Compétences acquises à la sortie de la formation : Connaissances de cas d’études illustrant l’intégration de données (i) génomiques et protéomiques à large échelle et (ii) protéomiques, génomiques et métabolomiques autour des histones. Connaissance de la mise en œuvre du projet aux niveaux expérimental et bioinformatique, et des difficultés et risques pouvant être rencontrés.

Durée : 3 heures.

Date et lieu : Lundi 16 septembre 2019 à 14h (Salle à confirmer).

Contacts pour l'inscription : Delphine PFLIEGER et Christophe BATTAIL

Inscription gratuite mais obligatoire, atelier limité à 40 participants.

Personnes connectées : 1